В целях соблюдения прав и интересов клиентов, в соответствии с законодательством в настоящее время действует четырехуровневая система контроля за деятельностью Европейского пенсионного фонда.

1. Государственный контроль

• Федеральная служба по финансовым рынкам (ФСФР) осуществляет регулирование деятельности негосударственных пенсионных фондов, в т.ч. через их лицензирование и контроль инвестиционной деятельности.
• Центральный банк России контролирует достаточность имущества для обеспечения уставной деятельности Фонда и то, как этим имуществом Фонд распоряжается.
• Федеральная налоговая служба контролирует правильность и своевременность уплаты Фондом налогов.
• Министерство здравоохранения и социального развития отслеживает соблюдение негосударственными пенсионными фондами прав и интересов участников и застрахованных лиц.
• Министерство юстиции следит за юридической чистотой деятельности Фонда.

2. Внутренний контроль

• Внутренний контролер – следит за соблюдением Фондом требований действующего законодательства.
• Ревизионная комиссия – осуществляет ревизию финансовой деятельности Фонда, контролируя учет и использование пенсионных взносов, а также соответствие законодательству порядка и размера выплат негосударственных пенсий.

3. Внешний контроль

• Попечительский совет Фонда контролирует соблюдение прав и интересов Вкладчиков и Участников Фонда, включая в себя их полномочных представителей. 
• Депозитарий ежедневно контролирует соблюдение законности инвестиционной деятельности Фонда. 
• Независимый аудитор ежегодно проводит проверку на правильность ведения финансово-хозяйственной деятельности Фонда. Аудиторские заключения публикуются и представляются в ФСФР.
• Независимый актуарий ежегодно в Фонде проводит независимое актуарное оценивание на возможность выполнения Фондом принятых на себя обязательств. Актуарий оценивает стоимость пенсионных обязательств, проводит оценку и дает прогноз стоимости активов Фонда. По завершении актуарного оценивания составляется заключение о платежеспособности Фонда по взятым на себя обязательствам и предоставляется в ФСФР.

4. Управление

• Совет Фонда устанавливает принципы и порядок деятельности Фонда, утверждает внутренние нормативные документы, бюджет, отчетность и т.д.
• Президент Фонда организует контроль за полным и своевременным поступлением в Фонд пенсионных накоплений, обеспечивает раскрытие информации о Фонде и ведет оперативное управление деятельностью Фонда.
• Инвестиционный комитет следит за соблюдением порядка формирования инвестиционных портфелей Фонда.